蛋白质分子量计算器

作者: Henrick Yau
- July 21, 2026
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蛋白质分子量计算器

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有效

蛋白质的分子量通过其氨基酸残基的平均同位素质量之和计算：

\[ MW = \sum (n_i \times MW_i) - (n_{肽键} \times MW_{H_2O}) \]

其中：

  • \(n_i\) = 序列中每种氨基酸的数量
  • \(MW_i\) = 每种氨基酸的分子量
  • \(n_{肽键}\) = 肽键总数
  • \(MW_{H_2O}\) = 水分子分子量（18.02 Da）

什么是蛋白质分子量计算器？

蛋白质分子量计算器可根据氨基酸序列或组成，帮助确定蛋白质的分子量。它还能计算理论等电点（pI）、消光系数、疏水性（GRAVY评分）以及pH 7时的净电荷等附加属性。

如何使用计算器

计算器提供多种输入蛋白质数据的方式：

  • 序列法：使用单字母氨基酸代码输入蛋白质序列。
  • 组成法：手动输入每种氨基酸的数量。
  • 高级选项：应用乙酰化、二硫键或末端修饰等修饰。

主要功能

  • 以道尔顿（Da）和千道尔顿（kDa）两种单位计算分子量。
  • 基于氨基酸pKa值确定理论pI。
  • 计算280 nm紫外吸光度的消光系数。
  • 通过GRAVY评分估算疏水性。
  • 考虑磷酸化、甲基化和酰胺化等自定义修饰。

为什么蛋白质分子量很重要？

了解蛋白质的分子量对于以下方面至关重要：

  • 电泳分析（SDS-PAGE、Western blotting）。
  • 质谱鉴定。
  • 蛋白质纯化和色谱分析。
  • 结构和功能研究。

常见问题

理论pI如何计算？

等电点（pI）是蛋白质净电荷为零时的pH值。它通过Henderson-Hasselbalch方程计算：

\[ pI = \frac{pKa_{正电荷} + pKa_{负电荷}}{2} \]

什么是消光系数？

消光系数通过色氨酸（W）、酪氨酸（Y）和胱氨酸（C）残基的数量计算：

\[ \varepsilon = (n_W \times 5500) + (n_Y \times 1490) + (n_C \times 125) \]

计算器如何处理修饰？

计算器允许应用各种翻译后修饰，这些修饰会从蛋白质分子量中增加或减去相应质量。

什么是GRAVY评分？

亲水性平均值（GRAVY）评分是衡量蛋白质疏水性的指标。其计算公式为：

\[ GRAVY = \frac{\sum (疏水性_{AA} \times n_{AA})}{总氨基酸数} \]

为什么计算中要包含水分子？

每个肽键形成都会损失一个水分子，因此总质量需相应调整。

结论

蛋白质分子量计算器是生物化学和分子生物学领域研究人员和学生的宝贵工具。无论是分析蛋白质结构、进行实验还是解读结果，该工具都能快速准确地提供关键的分子属性。